Un nouveau type de congrès est organisé depuis 2008 entre les congrès généraux, également tous les quatre ans. Comme son nom l’indique, chaque congrès thématique s’intéresse à une thématique particulière qui fait l’objet d’une analyse à travers une pluralité de perspectives.

L’Académie saisit, à l’occasion de la tenue de ces congrès thématiques, l’opportunité de visiter des régions du globe qui ont été moins fréquentées lors des précédents congrès généraux, plus particulièrement l’Afrique, l’Amérique latine et l’Asie.